U Odsjeku za sanitarnu mikrobiologiju i biologiju okoliša provode se:
- Mikrobiološka ispitivanja:
- svih vrste voda (površinske, podzemne, oborinske, pitke, prirodne izvorske, mineralne, stolne, bazenske, morske, tehnološke, otpadne, vode za hemodijalizu)
- hrane
- zraka
- klimatizacijskih sustava
- predmeta opće uporabe
- kozmetike
- sedimenta, pijeska, mulja
- brisova za kontrolu mikrobiološke čistoće objekata
- Biološka i ekotoksikološka ispitivanja:
- određivanje vrsta i broja peludnih zrnaca u zraku, medu i matičnoj mliječi
- određivanje vrsta komaraca
- mikroskopski pregled okolišnih uzoraka
- morskog i riječnog sedimenta u lukama, brodogradilištima, uzgajalištima i jezerima
- određivanje koncentracije klorofila A u vodama
- provođenje ekotoksikoloških testova vodenih uzoraka sa vrstama Daphnia magna i Vibrio fischeri
Ispitivanja se provode prema zakonima, pravilnicima, uredbama, zahtjevima inspekcijskih službi, epidemiološkim indikacijama, kao dio sustavnih ispitivanja okoliša (monitoringa) te prema zahtjevu stranke. Sve metode koje se provode su standardizirane. Za identifikaciju bakterijskih vrsta koje nisu dio standardno traženih parametara koriste se napredne tehnike i instrumenti koje mogu detektirati i nepoznate bakterijske vrste ili dati odgovor na izvor onečišćenja (MALDI-TOF, RT-PCR, FTIR).
Odsjek sudjeluje u velikom broju projekta čiji je cilj unapređenje i očuvanje okoliša i zdravlja ljudi.